Testei com as versões > 6.48.x e > 7.6

Requisitos ter um servidor FTP
Sugestão: Como criar um servidor FTP (Pure-FTPd) com usuário no banco de dados (MariaDB) usando Debian 10

Vamos ao script, você precisa alterar:
:global host ____IP/DNS_SERVIDOR_FTP____
:global usuario ____USER____
:global senha ____SENHA____
:global diretorio ____pastaX____

Acesse o menu: System >> Script e depois em [+]

O nome do arquivo será o mesmo que você definiu em System >> Identity, serão criado dois arquivos, uma backup e um export (AAAA-MM-DD.NOME.backup AAAA-MM-DD.NOME.rsc)

:log warning "***************************************"
# Conexão FTP
:global host ____IP/DNS_SERVIDOR_FTP____
:global usuario ____USER____
:global senha ____SENHA____
:global diretorio ____pastaX____
# Pega o nome do Router
:global identifica [/system identity get name ];
# Gera data no formato AAAA-MM-DD
:global data [/system clock get date]
:global meses ("jan","feb","mar","apr","may","jun","jul","aug","sep","oct","nov","dec");
:global ano ([:pick $data 7 11])
:global mestxt ([:pick $data 0 3])
:global mm ([ :find $meses $mestxt -1 ] + 1);
:if ($mm < 10) do={ :set mm ("0" . $mm); }
:global mes ([:pick $ds 7 11] . $mm . [:pick $ds 4 6])
:global dia ([:pick $data 4 6])
:log info "Gerando backup: $ano-$mes-$dia.$identifica.backup";
/system backup save name="$ano-$mes-$dia.$identifica";
:log info "Gerando export: $ano-$mes-$dia.$identifica.rsc";
/export file="$ano-$mes-$dia.$identifica"
:log info "Processando...";
:delay 5s
:log info "Conectando FTP Server...";
:log info "Enviando Backup [$ano-$mes-$dia.$identifica.backup] ...";
/tool fetch address=$host src-path="$ano-$mes-$dia.$identifica.backup" user="$usuario" password="$senha" port=21 upload=yes mode=ftp dst-path="$diretorio/$ano-$mes-$dia.$identifica.backup"
:log info "Enviando Export [$ano-$mes-$dia.$identifica.rsc] ...";
/tool fetch address=$host src-path="$ano-$mes-$dia.$identifica.rsc" user="$usuario" password="$senha" port=21 upload=yes mode=ftp dst-path="$diretorio/$ano-$mes-$dia.$identifica.rsc"
:delay 1
:log info "Backup enviado com sucesso...";
:log info "Removendo arquivos...";
 /file remove "$ano-$mes-$dia.$identifica.backup"
 /file remove "$ano-$mes-$dia.$identifica.rsc"
:log info "Rotina de backup finalizada...";
:log warning "***************************************";

Agora será preciso agenda-lo para execução a cada X período, no meu exemplo vou definir que todos os meio dias a cada 3 dias. Ajuste de acordo com suas necessidades:
Acesse o menu: System >> Scheduler [+]

Se estiver com preguiça pode copiar as linhas abaixo e colar no terminal, depois só alterar as variáveis.

/system script
add dont-require-permissions=no name=backup_ftp owner=remontti policy=ftp,reboot,read,write,policy,test,password,sniff,sensitive,romon source=":log warning \"***************************************\"\r\
    \n# Conex\E3o FTP\r\
    \n:global host ____IP/DNS_SERVIDOR_FTP____\r\
    \n:global usuario ___USUARIO___\r\
    \n:global senha ___SENHA___\r\
    \n:global diretorio ___NOME_DA_PASTA___\r\
    \n# Pega o nome do Router\r\
    \n:global identifica [/system identity get name ];\r\
    \n# Gera data no formato AAAA-MM-DD\r\
    \n:global data [/system clock get date]\r\
    \n:global meses (\"jan\",\"feb\",\"mar\",\"apr\",\"may\",\"jun\",\"jul\",\"aug\",\"sep\",\"oct\",\"nov\",\"dec\");\r\
    \n:global ano ([:pick \$data 7 11])\r\
    \n:global mestxt ([:pick \$data 0 3])\r\
    \n:global mm ([ :find \$meses \$mestxt -1 ] + 1);\r\
    \n:if (\$mm < 10) do={ :set mm (\"0\" . \$mm); }\r\
    \n:global mes ([:pick \$ds 7 11] . \$mm . [:pick \$ds 4 6])\r\
    \n:global dia ([:pick \$data 4 6])\r\
    \n:log info \"Gerando backup: \$ano-\$mes-\$dia.\$identifica.backup\";\r\
    \n/system backup save name=\"\$ano-\$mes-\$dia.\$identifica\";\r\
    \n:log info \"Gerando export: \$ano-\$mes-\$dia.\$identifica.rsc\";\r\
    \n/export file=\"\$ano-\$mes-\$dia.\$identifica\"\r\
    \n:log info \"Processando...\";\r\
    \n:delay 5s\r\
    \n:log info \"Conectando FTP Server...\";\r\
    \n:log info \"Enviando Backup [\$ano-\$mes-\$dia.\$identifica.backup] ...\";\r\
    \n/tool fetch address=\$host src-path=\"\$ano-\$mes-\$dia.\$identifica.backup\" user=\"\$usuario\" password=\"\$senha\" port=21 upload=yes mode=ftp dst-path=\"\$diretorio/\$ano-\$mes-\$dia.\$identifica.backup\"\
    \r\
    \n:log info \"Enviando Export [\$ano-\$mes-\$dia.\$identifica.rsc] ...\";\r\
    \n/tool fetch address=\$host src-path=\"\$ano-\$mes-\$dia.\$identifica.rsc\" user=\"\$usuario\" password=\"\$senha\" port=21 upload=yes mode=ftp dst-path=\"\$diretorio/\$ano-\$mes-\$dia.\$identifica.rsc\"\r\
    \n:delay 1\r\
    \n:log info \"Backup enviado com sucesso...\";\r\
    \n:log info \"Removendo arquivos...\";\r\
    \n /file remove \"\$ano-\$mes-\$dia.\$identifica.backup\"\r\
    \n /file remove \"\$ano-\$mes-\$dia.\$identifica.rsc\"\r\
    \n:log info \"Rotina de backup finalizada...\";\r\
    \n:log warning \"***************************************\";"

/system scheduler
add interval=3d name=backup_ftp on-event=backup_ftp policy=ftp,reboot,read,write,policy,test,password,sniff,sensitive start-date=dec/17/2019 start-time=12:00:00

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O post Criando backup do RouterOS/Mikrotik via FTP apareceu primeiro em Remontti.