Elementary OS deixou de dar suporte aos  PPA’s visando os riscos de estabilidade e segurança do sistema. Porém a solução não é muito complicada, para voltarmos a poder adicionar os PPA’s basta você instalar o pacote software-properties-common

$ sudo apt-get install software-properties-common

Depois disto, o processo de adição de PPA e instalação da aplicação é completamente normal:

$ sudo add-apt-repository ppa:philip.scott/elementary-tweaks
$ sudo apt update
$ sudo apt install elementary-tweaks

Versão do tweaks é disponibilizada por Felipe Escoto no GitHub.

Nesta nova versão ela está com um visual novo:

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